Счёт-фактуру следует выставить по правилам НК РФ, даже если по договору оплату перечисляют до конца месяца и в фиксированном размере.
Минфин
Получается, что если счёт-фактуру, в котором указана сумма оплаты до конкретного числа, выставить до окончания месяца, то это будет нарушением установленных в НК РФ норм. Однако не запрещено в счёте-фактуре за аренду указать в качестве даты последнее число месяца.
Ранее Минфин разъяснил, как начислять имущественный налог на арендованные ОС.