Сотрудникам, которые в течение календарного года стали налоговыми резидентами, нужно перечитать НДФЛ по ставке 13%, а остальное зачесть.
Минфин
Если в течение налогового периода нерезидент приобретает статус резидента, с начала года ему нужно пересчитать НДФЛ по ставке 13%, а образовавшуюся переплату зачесть при следующих начислениях налога. При этом такой зачёт можно производить только до конца года. Если всю переплату зачесть ещё не получилось, а год уже закончился, то резиденту нужно её вернуть. Для этого физлицу нужно обратиться в ИФНС.
Ранее ФНС сообщила об упрощении подтверждения статуса налогового резидента.