Так как объект используется в облагаемой НДС деятельности, суд решил, что вычет применить можно.
Учреждение реконструировало здание за счёт регионального бюджета. Зданием оно владеет на праве оперативного управления, и в его интересах действовало управление капстроительства, заключавшее контракты, передававшее учреждению связанные затраты и выставлявшее сводные счета-фактуры. По мнению ИФНС, так как реконструкцию провели за счёт бюджета, а деятельность учреждения по госзаданию не облагается НДС, то применение вычета неправомерно.
У судов по этому вопросу другое мнение. В частности, среди обоснований правомерности применения вычета можно выделить то, что управление капстроительства было не заказчиком, а посредником, действовавшим в интересах учреждения. Также НДС-вычет не зависит от того, что здание находится на балансе у учреждения, а реконструкция финансируется кем-то другим. Кроме того, устав учреждения предусматривает ведение разной деятельности, которая может быть не связана с основной.
Помимо этого, суд указал, что по проектно-сметной документации здание предназначено для ведения облагаемой НДС деятельности, а само учреждение уже использует здание в такой деятельности. Следовательно, учреждение имеет право на НДС-вычет.
Ранее Минфин разъяснил, как произвести НДС-вычет при оплате двум компаниям.
