Если налогоплательщик платит НДС с авансов по одной ставке, а товар реализует по разным, то полный вычет НДС с предоплаты ему не предоставят.
С авансовых платежей продавец по договору платил НДС 18%, а поставленные товары реализовывал по ставкам 18 и 10%. Продавец принял к вычету уплаченный налог в полном объёме, однако ИФНС не согласилась с расчётами. Суды трёх инстанций поддержали налоговиков, а ВС РФ отказался пересматривать дело.
В итоге получилось, что компания заплатила с авансов больше НДС, чем нужно было при отгрузке. Разницу налоговых сумм отнесли к излишне исчисленным налогам и запретили принимать её к вычету.
В подобных ситуациях вернуть НДС можно, но как переплату. Чтобы это сделать, в договоре необходимо указать, что при отгрузке размеры налогов с авансов нужно корректировать в зависимости от товара. В этом случае продавец сможет представить уточнённую декларацию за квартал, в котором уплатили аванс. Так как НДС в уточнёнке будет меньше, чем заявленный и уплаченный, разница составит налоговую переплату. При этом надо внимательно следить за сроками.
Ранее ВС РФ разъяснил, как отсчитывать сроки по НДС-вычетам от неотработанных авансов.