Если счёт-фактуру выставил банкрот, покупатель не может принять НДС к вычету.
Минфин в письме № 03-07-11/4780 от 31.01.2017 пояснил, что НДС к вычету принять нельзя, потому что реализация имущества банкротов не признаётся объектом обложения НДС. Следовательно, при таких операциях счета-фактуры не выставляются.
Если же продавец оформил счёт-фактуру с выделенным НДС, причин для его учёта нет, т.к. счёт-фактура не имеет силы.
Если же суммы НДС уже были приняты к вычету, налог следует восстановить.